军山为海中岛屿时，相传曾为秦王屯兵之地，因形似伏象，又名象山。俯瞰军山，山水相依自然构成一幅八卦图。
明代山西高僧法空驻锡军山，创建普陀禅院，狼山总兵题榜出门，著名书法家董其昌撰写了《军山普陀别院碑记》，认为于浙江普陀山相比“不减珞珈真境”。寺庙、宴堂曾多达百余处，为昔日东南佛门胜地。山上古迹有：燕真人洞、白云泉、四贤祠、包公祠、董其昌碑刻及中国历史上早的民办气象台等。

重修后的普陀别院，坐北朝南，依据山形梯次式结构。圆通宝殿供奉着的是千手观音。翡翠观音楼则供奉着一尊世界上大的翡翠座像观音，院内两侧长廊绘有33应身观音石刻像，引人入胜的佛教观音文化在此得以集中、充分表现。新建景观有景区牌楼、中国观音净瓶、大观瀑、观景廊、望江台、潇湘榭等几十处之多，并与清碧涧溪、葱茏林木融为一体。

景区后期开发，将着力打造“东方养生文化圣地”——中华养生园。依托军山自然风光，江海神韵，结合南通“中国长寿之乡”的 盛誉，弘扬中华源远流长的儒驿道、民俗民间养生文化精华，未来的军山景区必将成为华东旅游版块上的一朵奇葩。